在BDSM中，纪律是由支配者设定规则，期望从属者遵守的实践。当预期的行为规则被打破时，通常会使用惩罚作为纪律手段。
惩罚
在BDSM中，规则的制定是为了让从属者（“sub”）知道如何行为以避免让支配者不悦。这些规则通常由支配者和从属者在任何BDSM场景或情境开始前设定并达成一致，规则也可以用来让从属者感到自卑，或用于“训练”新手从属者，尽管并非总是如此。支配者设定规则可能与场景相关（例如恐惧游戏），也可能与BDSM构建的世界之外的原因有关。当规则被打破，即使是无意的，也会使用惩罚作为纪律手段。惩罚本身可以是物理的（例如鞭打），也可以是心理的（例如公开裸露或圣水羞辱），或者两者结合。
纪律的目标是“教导”。在BDSM场景的背景下，仅以此让从属者感到自卑，通过扮演仿佛他们像孩子或动物一样被“教导”如何行为，这种行为是假装的，因为BDSM是性游戏，与现实无关。从属者应该如何行为，以及违反行为规则可能带来的后果。当从属者因违反设定规则而受到惩罚时，他们在性游戏的背景下“学会”自我克制，并成为“更好”的从属者。惩罚通常但不总是与错误相关，并且通常与错误的严重性和频率成比例。例如，第一次未经允许开口说话的惩罚可能是一个简单的约束（例如用口塞让其沉默）。同样，如果男性从属者的阴茎在未被允许的情况下勃起，即使是无意的，惩罚可能是使用贞操锁。
从属者也可能被给予选择自己惩罚的选项。例如，对于反复犯下的轻微错误，惩罚可以是选择接受几次鞭打或被牵着宠物绳在公共场合裸体游行。对于女性从属者的重大违纪行为，可能的选择是乳房折磨或阴部折磨。对于男性从属者的重大违纪行为，可能的选择是使用的工具类型（例如鞭子或藤条）以及被惩罚的身体部位（例如背部或臀部），并伴随一定数量的猛烈打击。
对BDSM从属者实施的惩罚，即使是涉及剧烈疼痛的严厉惩罚，也不应与虐待狂与受虐狂（S&M）中的惩罚混淆，尽管两者相似。S&M涉及为了从属者和/或支配者的身体快感而对从属者施加疼痛/折磨。在BDSM纪律中，给予的惩罚旨在从心理上的自卑感中获得快感，通过像孩子或动物一样被“教导”和惩罚，以及从属者在受罚时可能感受到的脆弱、拒绝和羞辱，以及在“学会”克服自卑感并通过道歉和情感上接受对其认为错误的惩罚后，从属者可能感受到的谦卑和脆弱。这两种活动的一个共同点是都有界限和安全词。
BDSM中的惩罚是在支配者和从属者双方同意下进行的。此类惩罚在BDSM场景开始或签署任何BDSM“奴隶合同”之前已经商定、设定和讨论过，从属者的不当行为通常也在活动开始前预先确定。BDSM是性游戏，此类惩罚并非在现实世界背景下进行，如前所述，BDSM活动是预先安排的，场景是虚构的，没有任何惩罚是因为从属者违反了任何实际的、现实的规则而实施的。BDSM场景之外有“规则”，例如使用安全词来表示不愿继续或对某项特定活动感到不适；而在游戏背景下的规则则是被设定为故意违反并受到惩罚的“游戏规则”。惩罚也不应与BDSM训练混淆，训练可能仅为了提高从属者的耐力极限而施加疼痛。有时，纪律可能完全避免惩罚，支配者严厉的目光或高声责骂可能就足以生效。
除了惩罚外，纪律还可能涉及正向强化。这包括奖励从属者的良好行为。例如允许睡在床上而不是硬地板上。